Учёт НДС для логистических компаний

Ставка НДС с 1 января 2026 года — 16%, и для логистики, где маржа часто измеряется процентами от стоимости перевозки, ошибка в базе сразу съедает прибыль. Если экспедитор показал оборотом всю сумму клиента вместо вознаграждения, он переплачивает налог; если не начислил НДС за нерезидента, получает доначисление с пеней.

Мы разбираем договоры компании по типам: агентские, прямые, складские, договоры с нерезидентами. Для каждого определяем базу, место реализации и документы, которые подтверждают особый порядок обложения международных перевозок. Затем ведём учёт ежемесячно: выписываем ЭСФ, проверяем входящие ЭСФ перевозчиков, начисляем НДС за нерезидента и сдаём 300.00.

Услуга подходит компаниям на ОУР, которые уже стоят на учёте по НДС или приближаются к порогу. Общие условия — на странице учёта НДС; если нужен полный учёт, удобнее бухгалтерское обслуживание логистики.

Логистика постоянно покупает услуги за рубежом: фрахт у иностранной линии, услуги зарубежного агента, обработку на терминале за границей. Если иностранная компания не состоит на учёте в Казахстане, а местом реализации услуги признаётся Казахстан, НДС за неё уплачивает казахстанский покупатель.

Что мы проверяем до оплаты:

• вид услуги и где она фактически оказана — у перевозки, экспедирования и агентских услуг разные правила;
• есть ли у нерезидента регистрация в Казахстане;
• документы — договор, инвойс, акт, подтверждение резидентства для применения международного договора по КПН у источника выплаты;
• в каком периоде возникает обязанность и как НДС попадёт в зачёт.

НДС за нерезидента уплачивают и плательщики упрощённой декларации, но у них нет зачёта — для них такой налог становится прямым расходом. Подробнее о ставках — в ответе какая ставка НДС в 2026 году.

Перевыставление — место, где ЭСФ логистической компании расходятся с учётом чаще всего. Правила, которых мы придерживаемся:

• ЭСФ на вознаграждение и ЭСФ на компенсацию расходов разделяются так, как это предусмотрено договором и отчётом экспедитора;
• суммы транзитных расходов в ЭСФ совпадают с документами исполнителей, а не с округлёнными суммами в счёте клиенту;
• дата оборота — дата акта или отчёта, ЭСФ выписывается не позднее 15 календарных дней после неё;
• если груз — товар из перечня, отдельно проверяем СНТ и движение по «Виртуальному складу».

Клиенту на ОУР важно получить ЭСФ, по которым он сможет взять НДС в зачёт, поэтому шаблоны ЭСФ согласовываем с крупными заказчиками заранее.

Учёт НДС для логистической компании — от 45 000 ₸ в месяц. Цена зависит от числа ЭСФ на приход и реализацию, количества нерезидентов и международных перевозок, наличия товаров из перечня «Виртуального склада».

Если компания только приближается к порогу, сначала сравниваем варианты на её цифрах в рамках бухгалтерского обслуживания логистики. Пакеты — на странице тарифов.