Многопрофильные клиники, медцентры, лаборатории, диагностические центры

Бухгалтер для частных клиник в Казахстане

Бухгалтер частной клиники сводит в один учёт деньги из разных источников: оплату ФСМС по госзаказу, реестры страховых компаний по ДМС, договоры с работодателями на медосмотры и кассу платных услуг. Мы ведём учёт многопрофильных клиник, медцентров и лабораторий на аутсорсинге — ТОО на ОУР или упрощёнке, онлайн по всему Казахстану.

Офис предприятия: стол с документами поставщиков и ноутбуком · Частные клиники

Многопрофильная клиника редко живёт на одной кассе. Часть приёмов и госпитализаций оплачивает ФСМС по договору в рамках ГОБМП и ОСМС, часть — страховые компании по ДМС и работодатели по договорам на медосмотры, остальное — сами пациенты. У каждого источника свои документы, сроки оплаты и сверки.

Второй слой — структура: отделения, собственная лаборатория, дневной или круглосуточный стационар. Лекарства и расходники уходят по отделениям, оборудование часто взято в лизинг, а в штате — врачи-совместители, медсёстры на сменном графике и дежуранты. От разнесения доходов и затрат зависят и налоги, и понимание, какое направление окупается.

Мы ведём бухгалтерское обслуживание клиник онлайн: реестры, акты и выгрузки медицинской информационной системы — через облако или WhatsApp, учёт — в 1С с доступом руководителя к базе. Нам нужны суммы, даты и номера договоров, а не диагнозы; конфиденциальность закреплена в договоре. Узкопрофильному кабинету подойдёт страница для стоматологий.

§ 02С чем приходят

С какими задачами приходят частные клиники

  • —Акты по договору с ФСМС подписаны, но в 1С доход отражён по датам поступления денег, а суммы, снятые фондом по итогам мониторинга, так и остались в выручке.
  • —Страховые компании платят по реестрам с опозданием и частично, дебиторская задолженность по ДМС растёт, а сверку с каждым страховщиком никто не ведёт.
  • —Платные услуги, госзаказ и корпоративные медосмотры смешаны на одном счёте учёта, поэтому нельзя ни подтвердить условия ставки КПН для соцсферы, ни понять рентабельность направлений.
  • —Лекарства и расходники закупаются на всю клинику, но не списываются на отделения и стационар: остатки в программе расходятся с фактом, инвентаризация откладывается.
  • —Врачи совмещают работу в нескольких местах, дежурства и ночные смены считаются в таблице старшей медсестры, суммированный учёт рабочего времени не введён.
  • —Аппарат УЗИ или томограф получен в лизинг, но не поставлен на учёт как основное средство, а платежи лизингодателю проходят как текущие расходы.
§ 03Особенности учёта в Казахстане

Особенности учёта частных клиник в Казахстане в 2026 году

  • Лицензия по подвидам — медицинская деятельность ведётся по лицензии с приложениями на конкретные подвиды: амбулаторная помощь, стационар, лабораторная диагностика и другие. Новое направление открывают после переоформления приложения, а от лицензии зависят и пониженная ставка НДС, и ставка КПН для соцсферы.
  • Договор с ФСМС — услуги в рамках ГОБМП и ОСМС фонд оплачивает по актам оказанных услуг; доход признаём по акту, авансы фонда закрываем актами, а суммы, не принятые по итогам мониторинга качества и объёма, корректируем в периоде, когда о них стало известно.
  • ДМС и корпоративные договоры — страховые компании и работодатели платят по реестрам пролеченных пациентов и актам; по каждому контрагенту ведём отдельную сверку и контроль дебиторской задолженности.
  • НДС на медицину — в 2026 году медуслуги лицензированных организаций, лекарственные средства и медицинские изделия облагаются по ставке 5%, с 1 января 2027 года по Кодексу — 10% (возможны поправки); прочие обороты клиники, например сдача помещений или немедицинские услуги, — по общей ставке 16%.
  • КПН социальной сферы — для организаций медицины КПН в 2026 году — 5%, с 1 января 2027 года — 10%; ставка применяется при выполнении условий Кодекса, поэтому доходы от медицинской и прочей деятельности учитываем раздельно с первого месяца.
  • ЭСФ на медуслуги и медтовары — по ст. 208 НК при реализации медтоваров и медуслуг ЭСФ в отдельных случаях выписывают и неплательщики НДС; срок — не позднее 15 календарных дней после даты оборота, поэтому ЭСФ фонду, страховщикам и работодателям выписываем вместе с актами.
  • ККМ в регистратуре — при оплате пациентом наличными, картой или Kaspi QR нужен фискальный чек онлайн-ККМ; оплаты фонда, страховых компаний и работодателей поступают переводом на расчётный счёт и чека не требуют.
  • Медицинский штат — врачи-совместители, дежурства, ночные и праздничные смены, суммированный учёт времени в стационаре; трудовые договоры и табели должны совпадать с составом персонала, заявленным для лицензии и договора с фондом.
§ 04Какой режим обычно выбирают

Какой режим обычно выбирают частные клиники

Многопрофильные клиники и медцентры чаще работают как ТОО на общеустановленном режиме. Первая причина — ставка КПН для организаций социальной сферы: в 2026 году 5% вместо общих 20%, с 1 января 2027 года — 10%. Вторая — состав заказчиков: страховые компании и работодатели, как правило, на ОУР, а с 2026 года покупатель на ОУР не может относить на вычеты по КПН расходы, приобретённые у плательщика упрощённой декларации. При обороте свыше 10 000 МРП за год (в 2026 году 43 250 000 ₸) клиника на ОУР встаёт на учёт по НДС: медуслуги — по ставке 5%, НДС по закупкам лекарств и оборудования принимается в зачёт по правилам Кодекса. Минус ОУР для большого штата — социальный налог 6% с зарплаты.

Упрощённая декларация для ТОО подходит небольшому медцентру или лаборатории, которые работают в основном с пациентами-физлицами: 4% от дохода, лимит — 600 000 МРП за календарный год (в 2026 году 2 595 000 000 ₸), маслихаты меняют ставку в диапазоне 2–6%. НДС, кроме НДС на импорт, и социальный налог на упрощёнке не уплачиваются, а при доходе более 24 000 МРП с начала года облагаемый доход уменьшается на расходы по оплате труда. Выбор считаем на цифрах клиники: доходы по источникам, фонд оплаты труда, закупки и планы на 2027 год, когда ставки КПН и НДС для медицины по Кодексу вырастут.

ФормаПериодСрокКто сдаёт
100.00годдо 31 марта следующего годаТОО на ОУР, включая клиники со ставкой КПН социальной сферы
300.00кварталдо 15 числа второго месяца после квартала, НДС уплачивается до 25 числа того же месяцаклиники на ОУР, зарегистрированные по НДС
200.00кварталдо 15 числа второго месяца после квартала; за III квартал 2026 года — до 16 ноября 2026 годавсе ТОО, в том числе клиники на упрощёнке со штатом
910.00полугодиедо 15 августа и до 15 февраля; за II полугодие 2026 года — до 15 февраля 2027 годамедцентры и лаборатории в форме ТОО на упрощёнке
270.00годдо 15 сентября года, следующего за отчётнымучредители и руководители клиники — физлица из перечня обязанных

Факты актуальны на

§ 05Госзаказ и страхование

Как учитывать доходы клиники от ФСМС, страховых компаний и работодателей

Доход клиники признаётся по оказанной услуге, а не по дню, когда пришли деньги. Для госзаказа и страховых договоров это особенно важно: оплата может приходить через месяц и не на всю сумму. Поэтому каждый источник ведём отдельным разрезом в 1С:

ИсточникДокументЧто сверяем
ФСМС (ГОБМП, ОСМС)акт оказанных услуг по договорупринятые и снятые суммы, авансы фонда
Страховая компания (ДМС)реестр пациентов и акттарифы по договору, отказы в оплате
Работодательдоговор на медосмотры, список работников, актколичество осмотренных, цену за человека
Пациентчек ККМ, договор на платные услугикассу с медицинской программой

Снятые фондом суммы и отказы страховщика оформляем корректировкой дохода, спорные случаи выносим в отдельный список для администрации. Порядок ЭСФ по каждому заказчику фиксируем в учётной политике.

§ 06Отделения и склад

Как распределять лекарства, расходники и затраты по отделениям

Руководителю многопрофильной клиники нужно знать, во что обходятся приём терапевта, день в стационаре или анализ в своей лаборатории. Для этого учёт строим по центрам затрат:

  • склад медикаментов и медизделий — приход по накладным и ЭСФ поставщиков, выдача на отделения по требованиям старших медсестёр;
  • стационар — лекарства, питание пациентов, мягкий инвентарь и койко-дни отдельно от амбулаторных приёмов;
  • лаборатория — реактивы и расходники на исследования, анализы, переданные сторонней лаборатории, — по её актам;
  • общие затраты — аренда, коммунальные услуги, администрация — распределяем по согласованной базе, например по площади или выручке.

Раз в месяц проводим инвентаризацию склада и отделений. Препараты, которые требуют особого учёта, ведём отдельными журналами в том порядке, который клиника обязана соблюдать по лицензии.

§ 07Вопросы и ответы

Вопросы и ответы

Какой налоговый режим подходит многопрофильной клинике в 2026 году?

Как отражать суммы, которые ФСМС не принял по итогам мониторинга?

Как вести сверку со страховыми компаниями по ДМС?

Как оплачивать дежурства и ночные смены врачей и медсестёр?

Нужно ли открывать отдельное ТОО для аптеки при клинике?

Сколько стоит бухгалтер для частной клиники?

Оставить заявку

Обсудим учёт вашей клиники

Напишите в WhatsApp или оставьте заявку: бухгалтер уточнит направления, источники оплаты, штат и режим клиники и предложит порядок работы.

WhatsApp

Отправляя форму, вы соглашаетесь с политикой конфиденциальности.