Частные клиники

Учёт НДС для частных клиник

Клиника на ОУР с оборотом выше порога ведёт НДС по двум ставкам: 5% на медуслуги, лекарства и медизделия в 2026 году и 16% на прочие обороты. Мы ставим клинику на учёт, разделяем обороты и входящий НДС, выписываем ЭСФ и сдаём 300.00.

Стоимость
от 45 000 ₸
Срок
подключение за 1–2 рабочих дня
Отрасли
Частные клиники

Порог обязательной постановки на учёт по НДС — 10 000 МРП оборота за календарный год, в 2026 году это 43 250 000 ₸. Многопрофильная клиника с договором с фондом и страховыми договорами превышает его быстро, а в оборот включаются обороты по всем ставкам. Плательщики упрощённой декларации НДС не платят независимо от оборота, кроме НДС на импорт.

Для клиники на учёте по НДС главная задача — правильно разделить обороты. Медуслуги лицензированной организации, лекарственные средства и медизделия в 2026 году облагаются по пониженной ставке 5%, а сдача помещений, немедицинские услуги и прочие продажи — по общей ставке 16%. Ошибка в разнесении означает либо переплату, либо доначисление.

Мы ведём НДС клиники полностью: от контроля порога до сдачи формы 300.00. Общие условия — на странице учёта НДС, ставки и их изменения — в вопросе о ставке НДС в 2026 году.

§ 01Что входит

Что входит

01

Контроль порога

Считаем оборот нарастающим итогом по всем источникам оплаты и предупреждаем, когда клиника приближается к 10 000 МРП.

02

Постановка на учёт

Подаём заявление в течение 5 рабочих дней после превышения порога и перестраиваем учёт и договоры под НДС.

03

Разделение оборотов

Разносим медуслуги, лекарства и медизделия по ставке 5% и прочие обороты по ставке 16% по каждому договору.

04

Входящий НДС

Принимаем в зачёт НДС по ЭСФ поставщиков лекарств, оборудования и услуг, а по общим расходам применяем выбранный метод распределения.

05

ЭСФ заказчикам

Выписываем ЭСФ фонду, страховым компаниям и работодателям не позднее 15 календарных дней после даты оборота.

06

НДС на импорт

При ввозе оборудования и медизделий из стран ЕАЭС сдаём 328.00 и уплачиваем НДС на импорт.

07

Декларация 300.00

Сдаём декларацию за квартал до 15 числа второго месяца после него и контролируем уплату до 25 числа.

§ 02Особенности учёта в отрасли

Особенности НДС в частных клиниках

  • —Пониженная ставка привязана к лицензии — 5% применяется к медуслугам лицензированных организаций, поэтому услуги вне лицензии, например немедицинская косметология, идут по 16%.
  • —Порог по всем ставкам — для порога 10 000 МРП складываются обороты по 5% и 16%, а также все филиалы одного ТОО.
  • —Срок постановки сократился — заявление подаётся в течение 5 рабочих дней после превышения порога, ранее давалось 10 рабочих дней после окончания месяца.
  • —Лекарства в стационаре — препараты, использованные при лечении, входят в стоимость медуслуги, а отдельная продажа лекарств через аптечный пункт — самостоятельный оборот со своей ставкой.
  • —Распределение входящего НДС — по расходам, которые относятся одновременно к оборотам по разным ставкам, метод распределения фиксируем в учётной политике.
  • —Штраф за позднюю регистрацию — за несвоевременное заявление предусмотрен штраф 50 МРП, а за обороты в период непостановки на учёт — 15% от оборота; нормы КоАП сверяем по актуальной редакции.
  • —2027 год — по действующей редакции Кодекса ставка на медуслуги, лекарства и медизделия с 1 января 2027 года — 10%, договоры с заказчиками на 2027 год стоит готовить с оговоркой о ставке.
§ 03Какие формы сдаём

Какие формы сдаём

ФормаПериодСрокКто сдаёт
100.00годдо 31 марта следующего годаТОО на ОУР, включая клиники со ставкой КПН социальной сферы
300.00кварталдо 15 числа второго месяца после квартала, НДС уплачивается до 25 числа того же месяцаклиники на ОУР, зарегистрированные по НДС
200.00кварталдо 15 числа второго месяца после квартала; за III квартал 2026 года — до 16 ноября 2026 годавсе ТОО, в том числе клиники на упрощёнке со штатом
910.00полугодиедо 15 августа и до 15 февраля; за II полугодие 2026 года — до 15 февраля 2027 годамедцентры и лаборатории в форме ТОО на упрощёнке
270.00годдо 15 сентября года, следующего за отчётнымучредители и руководители клиники — физлица из перечня обязанных

Факты актуальны на

§ 04Ставки

Как клинике разделять обороты по ставкам 5% и 16%

В одной клинике обычно есть обороты по обеим ставкам, и разделять их нужно не в конце квартала, а при каждом акте и чеке. Ориентир такой:

ОборотСтавка в 2026 году
Медуслуги по лицензии: приёмы, диагностика, анализы, стационар5%
Лекарственные средства и медицинские изделия5%
Сдача помещений и оборудования в аренду16%
Немедицинские услуги и прочие продажи16%

В 1С за каждой номенклатурой услуг закрепляем ставку, а прайс клиники сверяем с приложениями к лицензии: услуга, которой нет в лицензии, пониженную ставку не получает. По входящему НДС ведём раздельный учёт: что относится только к медуслугам, что к прочим оборотам, что к обоим. Как встать на учёт и что меняется после регистрации, разобрано в вопросе о постановке на учёт по НДС.

§ 052027 год

Что изменится по НДС для клиник с 2027 года

По действующей редакции Налогового кодекса пониженная ставка на лекарства, медизделия и медуслуги с 1 января 2027 года вырастет с 5% до 10%. В проекте поправок обсуждалось сохранение 5%, но на ноябрь 2026 года закон не принят, поэтому планируем по Кодексу и следим за изменениями.

Что стоит сделать клинике до конца 2026 года:

  • проверить договоры со страховыми компаниями и работодателями: указана ли цена с НДС и как она меняется при изменении ставки;
  • обновить прайс платных услуг и настройки ККМ к началу года;
  • разграничить акты за декабрь и январь, чтобы обороты попали под правильную ставку;
  • пересчитать модель режима: ставка КПН соцсферы с 2027 года тоже вырастет — с 5% до 10%.

Когда закон о поправках будет принят, обновим настройки учёта и сообщим клиентам, что изменилось.

§ 06Стоимость

Стоимость

Учёт НДС для клиники — от 45 000 ₸ в месяц. Цена зависит от числа ЭСФ на приход и реализацию, количества заказчиков, импорта из ЕАЭС и сложности распределения входящего НДС между ставками.

Если клиника только приближается к порогу, сначала стоит сравнить упрощёнку и ОУР с НДС на её цифрах — это входит в бухгалтерское обслуживание клиники. Пакеты — на странице тарифов.

§ 07Вопросы и ответы

Вопросы и ответы

Платит ли НДС клиника на упрощёнке с большим оборотом?

Какая ставка НДС на услуги лаборатории?

Нужно ли выписывать ЭСФ пациентам-физлицам?

Что будет, если клиника поздно встанет на учёт по НДС?

Можно ли принять в зачёт НДС по оборудованию, купленному в лизинг?

Другие услуги

Другие услуги: Частные клиники

Та же услуга для других отраслей

Оставить заявку

Наладим НДС клиники

Пришлите оборот за последние месяцы и перечень услуг — проверим порог, ставки и предложим порядок работы.

Услуга: Учёт НДС для частных клиник
WhatsApp

Отправляя форму, вы соглашаетесь с политикой конфиденциальности.