Аптеки, аптечные пункты, сети аптек, фармдистрибьюторы

Бухгалтерское обслуживание для аптек и аптечных сетей

Учёт аптеки держится на трёх вещах: товарный запас с сериями и сроками годности, кассовая выручка по каждой точке и правильная ставка НДС на каждую позицию, если аптека его платит. Мы ведём бухгалтерию аптек, аптечных пунктов и сетей на упрощёнке и ОУР — онлайн, в 1С, по всему Казахстану.

Офис предприятия: стол с документами поставщиков и ноутбуком · Аптеки

В 2026 году для аптек изменилось сразу несколько правил. Новый Налоговый кодекс ввёл пониженную ставку НДС 5% на лекарственные средства и медицинские изделия, а товары вне этого перечня — косметика, БАД, средства гигиены — облагаются по общей ставке 16%. С 1 января 2027 года по действующей редакции Кодекса льготная ставка составит 10%, так что справочник товаров и цены придётся пересматривать ещё раз.

Вторая особенность — сам товар. В аптеке тысячи наименований с разными сериями и сроками годности, часть препаратов подлежит маркировке, а приход идёт от нескольких дистрибьюторов с отсрочкой платежа, возвратами и бонусами. Остатки в 1С должны совпадать с аптечной программой, кодами маркировки и фактом на полке, а долги поставщикам — с их актами сверки.

Мы берём бухгалтерское обслуживание аптеки на себя: принимаем документы через WhatsApp или облако, ведём учёт в 1С с доступом владельца к базе, сверяем кассы и Kaspi по каждой точке и закрываем месяц до срока платежей. Каждый месяц вы получаете акт выполненных работ с перечнем сделанного.

§ 02С чем приходят

Типичные проблемы в учёте аптек

  • —Аптека на ОУР применяет одну ставку НДС ко всему ассортименту: лекарства, косметика и БАД не разделены по ставкам 5% и 16%, и декларация 300.00 расходится с данными ККМ.
  • —Остатки в 1С не совпадают с аптечной программой и полкой: пересортица по сериям, неоформленные возвраты дистрибьюторам, инвентаризация давно не проводилась.
  • —Просроченные препараты месяцами числятся в остатке: актов списания и документов об уничтожении нет, недостача всплывает только при пересчёте.
  • —Коды маркировки при приёмке и продаже сканируются не всегда, и в системе маркировки накопились расхождения с фактическими продажами.
  • —Долг перед дистрибьюторами известен только по их данным: бонусы, скидки за объём и возвраты не отражены, акты сверки давно не подписывались.
  • —В сети из нескольких точек оплаты Kaspi и эквайринга не разнесены по аптекам, и непонятно, какая из них зарабатывает, а какая работает в минус.
§ 03Особенности учёта в Казахстане

Что важно в учёте аптеки в 2026 году

  • НДС 5% и 16% — в 2026 году лекарственные средства и медицинские изделия облагаются по пониженной ставке 5%, остальной ассортимент — по общей ставке 16%; с 1 января 2027 года по действующей редакции Кодекса льготная ставка — 10% (возможны поправки).
  • Раздельный учёт ставок — у плательщика НДС каждая позиция номенклатуры в 1С и в кассе привязана к своей ставке, иначе налог с продаж и зачёт по ЭСФ дистрибьюторов посчитаются неверно.
  • Лицензия на фармдеятельность — продажа лекарств возможна только по лицензии с нужным подвидом; при открытии новой точки, переезде или смене фармацевтов проверяем, что лицензионные и квалификационные требования соблюдены.
  • Маркировка — коды маркированных препаратов фиксируются при приёмке от дистрибьютора и выбывают при продаже; данные системы маркировки, ККМ и складского учёта сверяем между собой.
  • Сроки годности — остатки контролируем по сериям и срокам, просрочку и брак списываем актами с подтверждением уничтожения, инвентаризацию проводим по графику.
  • ККМ и Kaspi — каждая точка работает с онлайн-ККМ из госреестра; оплата через Kaspi QR приравнивается к оплате картой, поэтому фискальный чек нужен на каждый расчёт.
  • ЭСФ на медтовары — неплательщики НДС, в том числе на упрощёнке, выписывают ЭСФ при реализации медтоваров (ст. 208 НК); на практике это прежде всего продажи клиникам и организациям по договору.
  • ОСМС и лекарственное обеспечение — аптеки, работающие по договорам с ФСМС в системе бесплатного лекарственного обеспечения, ведут отдельный учёт отпуска по рецептам, поступлений от фонда и расчётов с ним.
§ 04Какой режим обычно выбирают

Какой налоговый режим подходит аптеке

Отдельные аптеки и небольшие сети чаще всего работают на упрощённой декларации для ТОО: 4% от дохода, лимит — 600 000 МРП за календарный год (в 2026 году 2 595 000 000 ₸), ограничения по численности работников нет. Маслихаты устанавливают ставку в диапазоне 2–6%, поэтому её проверяем по адресу аптеки. Плательщики упрощёнки не являются плательщиками НДС независимо от оборота, и вопрос раздельных ставок 5% и 16% их не касается, но ЭСФ при продаже медтоваров организациям выписывать всё равно нужно.

ОУР выбирают аптеки, которые много продают клиникам и компаниям на ОУР: с 2026 года такой покупатель не может относить на вычеты по КПН расходы на товары, купленные у плательщика упрощённой декларации. На ОУР КПН — 20%, а после оборота 10 000 МРП за год (в 2026 году 43 250 000 ₸) аптека встаёт на учёт по НДС и начисляет налог по ставкам 5% и 16%. Как устроен этот режим, разобрано на странице плательщика НДС; выбор мы делаем на цифрах конкретной аптеки — ассортименте, доле продаж организациям и входящем НДС от дистрибьюторов.

ФормаПериодСрокКто сдаёт
910.00полугодиедо 15 августа и до 15 февраля; за II полугодие 2026 года — до 15 февраля 2027 годааптеки на упрощёнке — ТОО и ИП
200.00кварталдо 15 числа второго месяца после квартала; за III квартал 2026 года — до 16 ноябрявсе ТОО; ИП на упрощёнке — при работниках или ГПХ
300.00кварталдо 15 числа второго месяца после квартала, уплата — до 25 числааптеки на ОУР, зарегистрированные по НДС
100.00годдо 31 марта следующего годаТОО на ОУР
220.00годдо 31 марта следующего годааптечные пункты — ИП на ОУР

Факты актуальны на

§ 05НДС по ставкам

Как аптеке на ОУР вести раздельный учёт НДС 5% и 16%

Если аптека зарегистрирована по НДС, налог с каждой продажи зависит от того, что именно продано. Лекарственные средства и медицинские изделия в 2026 году облагаются по ставке 5%, остальной ассортимент — по ставке 16%. Ошибка в карточке товара повторяется во всех чеках, и расхождение между ККМ, 1С и декларацией 300.00 становится поводом для камерального контроля. Поэтому учёт строим так:

  • в номенклатуре 1С и в кассовой программе у каждой позиции своя ставка, новые позиции проверяем до первой продажи;
  • выручку по ставкам ежемесячно сверяем с Z-отчётами и данными ОФД;
  • в ЭСФ дистрибьюторов проверяем ставку по каждой строке, ошибочные возвращаем на исправление;
  • заранее готовим справочник к 2027 году, когда льготная ставка по действующей редакции Кодекса станет 10%.

На упрощёнке НДС не возникает, но разметка ассортимента всё равно пригодится — при переходе на ОУР или выходе за лимит дохода.

§ 06Товар и сроки

Как учитывать остатки, маркировку и просрочку в аптеке

Главный актив аптеки — товарный запас, и большинство ошибок учёта связано именно с ним. Препараты приходят партиями с разными сериями и сроками годности, часть из них маркирована, а возвраты и пересортица случаются каждую неделю. Порядок, который мы поддерживаем:

  • приход — по накладным и ЭСФ дистрибьютора, с проверкой серий, сроков и кодов маркировки при приёмке;
  • продажа — через ККМ со сканированием кода маркированного препарата, чтобы выбытие в системе совпадало с чеками;
  • просрочка и брак — актом списания с перечнем серий и подтверждением уничтожения, в том же месяце;
  • инвентаризация — по графику и при смене материально ответственного фармацевта, итоги — в учёт тем же месяцем.

С дистрибьюторами регулярно подписываем акты сверки: так в балансе видны реальные долги, а бонусы и возвраты не теряются.

§ 07Вопросы и ответы

Вопросы и ответы

Какая ставка НДС на лекарства в 2026 году?

Платит ли НДС аптека на упрощёнке?

Нужно ли сканировать коды маркировки при продаже лекарств?

Как списать просроченные лекарства?

Как вести учёт, если у ТОО несколько аптек?

Сколько стоит бухгалтер для аптеки?

Оставить заявку

Разберём учёт вашей аптеки

Напишите в WhatsApp или оставьте заявку: бухгалтер уточнит режим, число точек и касс, ассортимент и работу с маркировкой и предложит порядок обслуживания.

WhatsApp

Отправляя форму, вы соглашаетесь с политикой конфиденциальности.